事已至此，亚历山大主教和总督大人也没有其他的办法，听说利玛窦有中国人的门路，立刻允许利玛窦乘坐最快的船前往澳门，从澳门抵达广东，找寻他的友人，询问事情的真相。
于是，抵达菲律宾马尼拉三个小时以后，利玛窦就再次登上了海船，尚未洗去一身的疲劳，就又一次作为外交使节为了教会而服务，为了南海的和平而服务，从这一点上来说，利玛窦并不觉得自己的行为是有悖于宗教传统的。
所以尽管他很疲劳，却也不辞辛苦的前往澳门，希望得到具体的消息，以避免这场在他看来没有必要也最好不要发生的战争，否则，他们天主教团是否可以继续存在于东方都是个很难解释的话题。
萧如薰的确同情达理，眼界开阔，也很喜欢西方的科学知识，但是利玛窦也知道，这位将军也有强硬和不讲人情的一面。
一旦有人违背了他的命令，他会毫不犹豫的予以非常严重的惩罚，甚至是杀死他，老实说，利玛窦有点害怕这位将军，但是没办法，为了自己的使命，利玛窦不愿意离开他。
他在中国内地辗转生活的几年里面结识了不少士人，但是大多数都是在野士人，也就是不担任官职的士人，他对中国的系统有了解，知道中国的知识分子是通过读书考试来考取官位的。
他最初知道这个事情的时候是无比激动的，因为比起欧洲用血缘传承世袭的官职制度，中国的制度无异于是理想的制度。
他对于这些通过自己的学识考取官职的官员非常的崇敬，认为这些官员都是中国的精英，是中国精英政治的代表，以结识他们为荣。
但是他们也都一样的心高气傲，而且事务繁忙，没有时间接见自己，出于这样的考量，利玛窦退而求其次，和那些很有名望和人脉的士子交往，以增加自己的名气和人脉。
瞿汝夔就是他的一个重要的教会层面的盟友和信徒，瞿汝夔是第一个受利玛窦的洗礼而信奉天主教的士人，对利玛窦提供了非常多的帮助，包括提醒他要改变自己的衣着打扮，穿上儒士的服装，以『西儒』的身份重新融入中国社会，给了他非常大的帮助。
离开广东居住在缅甸之后，利玛窦也经常想起自己这位信徒和朋友，这一次前往澳门，他的目标就是联系上这位老友，从他的渠道打探中国政府对菲律宾的看法和这一次中国官府派船前往菲律宾的缘由。
前往澳门是很容易的，澳门是葡萄牙人在自治，允许他们这些外国人进入，但是从澳门进入广东就有点困难了，那需要官府的文书允许，一般外国人休想离开澳门进入广东一步，这种行为属于严重违法，是要被广东官员抓到衙门打板子的。
利玛窦发现中国官员好像很喜欢打人的班子，尤其是他们这些外国人，在缅甸萧如薰也是这样，中国人犯法了打十下板子，外国人犯法无论是谁都要打二十下板子，花钱赎罪都不行，官员不允许，非要打不可，你要逃可以，从此以后你就休想进入中国再做生意。