李恪将李言还有于家、元家两家收到自己麾下之后他便将狄知逊具体负责整合太原各世家的势力，让王中长带领鹰卫从旁协助，必要的时候可以动用武力。而他自己和苏定方、刘仁轨两人将精力放在了军队的训练上，而许敬宗自然跟随在李恪身边，负责军情的收集和汇总的同时还兼职着粮草的事务。
至于，柴哲威和李宗还有尉迟俊三人，李恪已经通过都督府给他征兆了三千新兵，命令经验丰富的陈其协助训练。而李恪下令让侯虎寻找的鸦片的种子已经带回了太原，吩咐人在城外选择了一块地方建立了温室大棚，开始培育鸦片的种子，目的是以备来年能够在太原府地域大面积种植。
同时，他还是将长安为他做证的郎中圣德言召到了太原，对外说的作为都督府的御用大夫，但李恪实际的想法的想利用他医学专长为自己提炼鸦片，使得自己能够获得纯度更好的****。
时间过的很快，转眼间贞观二年已经结束，迎来了新的一年，既贞观三年，在贞观三年发生的第一件事情就是，沙门法雅因妖言惑众被处死。司空裴寂曾闻其言而没有上奏，贞观三年正月，裴寂被免官，遣回故乡蒲州。裴寂请求留在长安，李世民不许，并指责他功不补过。武德年间身居相位而朝政不清，都是他的责任，裴寂返回故乡蒲州后不久，又因狂夫信行妄言裴寂有天命，裴寂又没报告，应当被处以死刑，但李世民只将他流放到静州（今广西昭平县）。后来山羌起事，有人要劫持裴寂为主。裴寂带领家僮攻败山羌。李世民顾念裴寂曾经帮助高祖起事，便下令征他入朝，而裴寂召还即卒。
第二件事情就是，贞观三年正月，长孙无忌请罢右仆射。但是长孙无忌与李世民为布衣之交，即在李世民未起兵之前已与他关系很好，又加上长孙无忌是长孙皇后之兄，并且在玄武门事变中起过重要作用，所以李世民对他非常信任，为其它大臣所不及，在他没有被任命为尚书仆射时就多次想用他为宰相，现在已经身为尚书右仆射长孙后请求罢右仆射，李世民怎么能答应呢。但是，在经过长孙无忌的多次请求和长孙皇后的多番劝谏，李世民终于还是免除长孙无忌的右仆射，而授以他司空的职位，开府仪同三司，任能参与政事。如此一来，长孙无忌不但没有被免职，反而权利更胜从前，这是任何人都没有预料到的结果。而因为长孙无忌尚书右仆射被空出，萧禹又免职在家，贞观三年三月，李世民以房玄龄为左仆射，杜如晦为右仆射，均参与朝政。而房玄龄善谋略，杜如晦善决断，李世民的这次任命让两人在唐朝历史上留下了名相，“房谋杜断”的美誉。
同时，李世民在又发布一项命令，即申明审驳制度。唐朝初年，凡国家军政大事，中书舍人各依自己的见解，签署自己的名字，被称做五花判事。由中书侍郎、中书令审查，由给事中、黄门侍郎校正。贞观三年四月，李世民重新申明旧的制度，于是很少发生错事。
第三件事情就是大唐上至王公贵族，下至黎明百姓都最为关心大唐跟突厥的战争。在突厥突利可汗建牙帐在幽州的北边，统治东部地区，奚、霄等数十部大多叛变突厥投降唐朝，其叔颉利可汗因此而责备突利。随后颉利又因当初薛延陀、回纥打败欲谷设后，颉利派遣突利前去讨伐，突利又战败为由旧事重提，将突利囚禁了十多天，并且鞭挞他，突利因此生怨言，背地里要反叛颉利。颉利向突利征兵，突利不给，上表唐太宗请求入朝。于是，颉利带兵攻打突利。